针对工程管理专业硕士的综合性、应用性特点，MEM课程设置充分考虑了工程管理实践对专门人才的知识与素质要求，依托管理门类学科优势，突出了工程与管理学科相结合的特色。注重培养学生的实际分析能力和创造性解决实际问题的能力。 针对不同行业（建设工程、供应链工程、信息系统工程、质量工程、物流系统工程等）和企业需求设置了灵活的模块式特色方向课程，并可为企业不同的特色方向及课程体系。